En 1960, Danny Shapiro es un adolescente cuya madre padece una grave enfermedad. Para escapar de tan terrible realidad, Danny comienza a escribir una historia en la que es miembro de un club de investigadores de ovnis, da esquinazo a los hombres de negro y consigue a la chica más deseable que se pueda imaginar. Desde Filadelfia y Miami hasta Jordania e Israel, pasando por el desierto de Nuevo México y un lugar muy parecido al infierno, Diario de un investigador de ovnis trata de la pérdida de la inocencia y de las ilusiones que creamos para protegernos de la inevitabilidad de la muerte.